能力建设由同级财政承担
根据《方案》规定，医疗卫生领域中能力建设，主要包括医疗卫生机构改革和发展建设、卫生健康能力提升、卫生健康管理事务、医疗保障能力建设、中医药事业传承与发展。
其中，国家对医疗卫生机构改革和发展建设的补助为中央财政事权或地方财政事权，由同级财政承担支出责任。符合区域卫生规划的中央所属和地方所属医疗卫生机构改革和发展建设分别由中央财政和地方财政承担支出责任。中央所属医疗卫生机构承担地方政府委托任务的，由地方财政给予合理补助；地方所属医疗卫生机构承担中央财政事权任务的，由中央财政给予合理补助。
国家根据战略规划统一组织实施的卫生健康人才队伍建设、重点学科发展等项目明确为中央与地方共同财政事权，由中央财政和地方财政共同承担支出责任，中央财政根据工作任务量、补助标准、绩效考核情况等因素分配对地方转移支付资金。地方自主实施的能力提升项目明确为地方财政事权，由地方财政承担支出责任。
卫生健康管理事务、医疗保障能力建设按照承担职责的相关职能部门隶属关系分别为中央财政事权或地方财政事权，由同级财政承担支出责任。
在深化医药卫生体制改革期间，中央财政对地方推进公立医院综合改革以及地方医疗保障能力建设等按规定给予补助，中央财政和地方财政按照规定落实对社会力量办医的补助政策。中医药事业传承与发展为中央与地方共同财政事权，由中央财政和地方财政共同承担支出责任，中央财政根据工作任务量、绩效考核情况、地方财力状况等因素分配对地方转移支付资金。
此外，《方案》还强调，地方政府制定出台地区标准要充分考虑区域间基本医疗卫生服务的公平性、当地经济社会发展水平和财政承受能力，确保财政可持续。
为确保改革顺利推进，《方案》要求，中央与地方财政事权和支出责任划分改革要同深化医药卫生体制改革紧密结合、统筹推进，完善省以下分担机制，合理安排预算，根据“谁使用、谁负责”的原则全面实施绩效管理，保障基本医疗卫生服务的有效提供。修订完善规章制度，确保行政权力在法律和制度的框架内运行。