不利于创新和技术进步
党的十九大报告指出，中国目前还存在发展不平衡不充分的问题，其中重要的一点就是创新能力不够强。房地产投资的高回报会导致实体企业失去创新的动力，从而弱化全社会创新的步伐。
之所以制造业等实体部门愿意从事创新活动，是因为创新能够带来竞争优势和更多的利润。但是，创新是高风险的活动，不管是在新技术和新产品的研发阶段，还是新产品开拓市场阶段，都面临着一系列的风险。如果房地产投资能够提供较高而且稳定的回报，那么企业从事创新活动的动机无疑会减弱。不仅如此，一旦企业将大量资金投向房地产，将会挤占研发投入，这同样会减弱实体部门创新的步伐。大量研究发现，房价上涨越快的地区，实体部门企业研发投入和专利授权量越低。这应该是中国实体企业的研发投入增长较为缓慢的重要原因之一。
高房价还会导致青年科研人员想方设法挣钱买房，而无法专心从事基础性和原创性的科研活动。青年科研人员精力充沛、创新思维活跃，是全社会创新研发的主力军。要想让他们潜心投入到创新研发活动中，需要让他们拥有住房等基本生活条件。在房价持续大幅上涨的背景下，青年科研人员仅凭基本的工资收入很难购买住房。以北京为例，截至2016年底东城区、西城区和海淀区的房价分别高达9.7、11.4和8.0万元/平方米，而北京城镇科学研究和技术服务业在岗职工的年均收入只有15万元左右。在此情形下，青年科研人员通常难以潜心从事基础性、原创性的科技研发活动，而是设法从事与创新无关的“副业”来增加额外收入。近年来媒体发布的“高房价等因素使青年科学家‘无心科研’”、“一枚中科院科研人员的自白：我为什么选择离开”等报道表明高房价对青年科研人员的不利影响已经不容忽视。如果房价继续上涨，那么将会导致更多的青年科研人员失去创新研发的动力，从而进一步阻碍中国技术进步的步伐。
导致资源错配不利于效率改进
所谓效率改进，是指改进生产要素与技术的结合方式，将生产要素等资源更多地配置给高生产率的部门和产业。如果低生产率的部门和产业占用了过多资源，那么将会导致资源错配和效率损失。
房地产行业本身的技术含量和生产效率就相对较低，因此过度依赖房地产自然会引发房地产部门与实体部门之间的资源错配。不仅如此，房地产还会阻碍产业结构升级，从而引发落后产业和新兴产业之间的资源错配。房地产行业所拉动的钢铁、水泥、玻璃等行业大都是技术含量偏低并且产能过剩的落后行业。由于房地产能够创造出较为稳定的市场需求，因此它们既不会自动退出市场，也缺乏转型升级的动力。长此以往，房地产及其相关联的落后产业将会占据大量宝贵的信贷等资源，阻碍新兴产业的成长，从而引发落后产业和新兴产业之间的资源错配和效率损失。
事实上，房地产阻碍产业结构升级的迹象已经显现，透过富豪企业家的行业分布可见端倪。“胡润全球富豪榜”数据显示，2015年中国上榜富豪多达30%来自于房地产行业，在所有行业中排名第一。与之不同，发达国家的富豪企业家则主要来自新兴产业以及高端制造业，例如美国和日本富豪企业家来自于新兴产业以及高端制造业的占比分别高达23.3%和37.8%，而且在所有行业中高居首位，而我国只有10.1%。富豪企业家是一个国家的精英群体，是产业结构转型升级的引领者，当富豪企业家过多地集聚在房地产以及产能过剩的行业时，将会阻碍产业结构升级并导致落后产业和新兴产业之间的资源错配，不利于效率改进和长期经济增长。