上海市结合地方实际，按照“总量控制和结构调整、调整医疗服务价格与药品零差率销售联动、综合配套政策同步实施”三大原则积极推进改革，目前已初步建立起较为合理的医疗服务价格体系。
在此过程中，上海市注重采取“化整为零”的办法，药品加成率分步取消、医疗服务价格调整也分步进行，控制好每次调整的幅度，小步稳走，积小胜为大胜。同时，注重满足基本需求和体现技术价值并重，既保证基本医疗服务需求，又体现医务人员技术劳务价值，还注重鼓励需扶持学科的发展。
分步调整医疗服务价格。2015年以来，上海市采用分步到位的方法，取消药品加成，调整了近1400项医疗服务价格。2015年，将药品加价率由15%降至10%，提高护理费、诊查费、康复治疗费、精神卫生、儿科、床位费、中医针灸费等88项价格；2016年，再次将药品加价率由10%降至5％，提高三、四级手术和临床诊疗类、病理类、综合类、中医类等572项价格；2017年，将药品加价率由5%降至0，取消全部药品加成，提高手术类、临床诊疗类、中医类、核素和放射治疗类、康复类等737项医疗服务项目的价格。
改进医疗服务定价方法。一方面，通过综合分析上海价格水平与国际同等条件国家、国内大中型城市的价格关系，以及医疗服务项目内部之间的价格结构，形成目标价格体系。目前已经完成全部项目的比价工作，作为医疗服务价格调整的重要依据。另一方面，通过开展成本核算，从医院总成本、科室成本分析，逐步细化到项目成本分析，初步形成标准成本体系。目前已经完成瑞金医院等5家公立医院全部项目成本的测算工作。
实行综合配套改革。实施过渡性财政支持政策，对部分受影响较大的医院进行补贴，其中，市级医院和部属医院已经得到3亿元财政补贴资金，区级医院由区级财政保障到位，部队医院的补贴政策正在落实；实行医保政策同步调整，调价项目都纳入医保支付范围，并随着价格上调提高医保支付水平，特别将社会较为敏感的普通门诊诊查费上调的8元全部由医保基金支付；改进药品采购供应模式，开展药品带量采购、GPO集团采购试点，优化药品供应链，压缩流通环节的虚高水分；强化医药费用控制，严控医院2017年医疗费用增长率不超过10%，逐步降低药品、卫生材料收入占比。